16S/18S/ITS等扩增子测序

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16S rDNA其种类少,含量大,分子大小适中,存在于所有的原核生物中,由多个保守区和与之相间的多个可变区组成。其中保守区为所有细菌共有,可变区因细菌而不同。鉴于此,16S rDNA已成为细菌鉴别与分类研究中理想的靶序列。

18S rDNA是真核生物基因组中编码核糖体的基因,其与5.8S rDNA和28S rDNA基因组成一个转录单元,三者高度保守,适合于较高等级水平的生物群体间的系统分析。这个转录单元其间的间隔区为内转录间隔区(Internal Transcribed Spacer, ITS),包括ITS1和ITS2两部分,由于进化相对迅速且具多态性,因而适合于等级水平较低的系统学研究。

扩增子测序是对特定长度的PCR产物进行测序,分析序列中的变异。16S/18S/ITS等扩增子测序即通过提取环境样品的DNA,通过合适的通用引物扩增16S/18S/ITS的目标区域,以研究环境微生物多样性及群落组成差异。

安必奇为您提供一站式的扩增子测序技术服务,根据客户的研究需求,利用高通量测序技术,为您推出完整的扩增子测序解决方案,协助您一起探索生物奥秘。

我们的优势
• 先进的测序平台:测16S rDNA多V区、18S rDNA和ITS等高变区域,测16S单V区或双V区
• 高通量、高质量测序:准确性高,反应物种的真实情况
• 效率高、成本低:通量大、产出数据多
• 标准化的分析流程:标准分析、高级分析、定制化分析 br />
• 丰富的扩增子测序及分析经验
• 定制化的扩增子测序方案:可根据实际需求制定个性化的扩增子测序方案
技术流程
技术流程
数据分析
人全基因组重测序数据分析
样本要求
样本类型 总量 浓度 OD260/OD280
组织样品 >1.5g
基因组DNA ≥200ng ≥6ng/μl ≥ 1.8
PCR产物 ≥1μg ≥10ng/μl

技术参数
测序平台 测序策略 数据量 运转周期
HiSeq
MiSeq
PE250 根据具体项目情况而定,不低于合同约定的数据量 30-55个工作日

询价及订购

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参考文献
[1] Wuchter C, Banning E, Mincer T, et al. Microbial diversity and methanogenic activity of Antrim Shale formation waters from recently fractured wells [J]. Frontiers in microbiology, 2013, 4: 367.
[2] Cheng M, Qian L, Shen G, et al. Microbiota modulate tumoral immune surveillance in lung through a γδT17 immune cell-dependent mechanism [J]. Cancer research, 2014, 74(15): 4030-4041.
[3] Zhao L, Wang G, Siegel P, et al. Quantitative genetic background of the host influences gut microbiomes in chickens [J]. Scientific reports, 2013, 3.