ChIP-Seq

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染色质免疫共沉淀测序(Chromatin Immunoprecipitation Sequencing,ChIP-Seq)是指将深度测序技术与ChIP实验相结合分析全基因组范围内DNA结合蛋白结合位点、组蛋白修饰、特定转录因子的基因调控作用、核小体定位或DNA甲基化的高通量方法。随着新一代测序技术的发展和成熟,使得这项技术可应用到任何基因组序列已知的物种,并能确切得到每一个片段的序列信息,从而在全基因组范围对蛋白结合位点进行高效而准确的筛选与鉴定。

安必奇的ChIP-Seq技术服务具有成本低、效率高、检测灵敏度高和覆盖度高等优势,通过多年的发展以及多个项目经验的积累,以期为您的染色质免疫共沉淀测序项目提供完整的解决方案。

我们的优势
• 性价比高:实验周期短、分析信息全,针对感兴趣的区域及相关基因,用于大样本量及高深度研究
• 高灵敏度:实验对起始DNA量的要求很低,从而使得起始细胞数目的减少,更有利于早期胚胎发育相关的研究
• 灵活性强:可以应用到任何基因组序列已知的物种,并能确切得到每一个片段的序列信息
• 高分辨率:强大的生物信息计算能力,可以高效地将测序得到的序列定位到特定基因组的精确碱基位置上,分辨率大大提升
• 定制化的染色质免疫共沉淀测序方案:可根据实际需求制定个性化的染色质免疫共沉淀测序方案
技术流程

采用特异性抗体对目的蛋白进行免疫沉淀后,分离与其结合的基因组DNA片段,再通过高通量测序与数据分析,在全基因组范围内寻找目的蛋白的DNA结合位点,并且可以基于多个样品进行差异比较。

技术流程
数据分析
人全基因组重测序数据分析
应用领域
• 表观异质性
• 环境与表观遗传
• 基因表达调控
• 疾病研究
• 染色质重塑
• 遗传印记
• 遗传印记
样本要求
样本类型 总量 浓度 OD260/OD280
DNA ≥10ng ≥1ng/μl 1.8-2.0

技术参数
测序平台 测序策略 数据量 运转周期
HiSeq SE 50 20M或40M clean reads 视具体项目情况而定

询价及订购

感谢您选择我公司的ChIP-Seq测序服务。如有任何相关的问题,请您联系我们的工作人员,我们即刻为您解答和服务。

参考文献
[1] Lin C Y, Erkek S, Tong Y, et al. Active medulloblastoma enhancers reveal subgroup-specific cellular origins [J]. Nature, 2016.
[2] Hewitt S C, Li L, Grimm S A, et al. Research resource: whole-genome estrogen receptor α binding in mouse uterine tissue revealed by ChIP-seq [J]. Molecular endocrinology, 2012, 26(5): 887-898.
[3] Park P J. ChIP–seq: advantages and challenges of a maturing technology [J]. Nature Reviews Genetics, 2009, 10(10): 669-680.