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RNA Immunoprecipitation (RIP) 是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,是了解转录后调控网络动态过程的有力工具,能帮助我们发现miRNA的调节靶点。这种技术运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来,然后经过分离纯化就可以对结合在复合物上的RNA进行测序分析。

RNA Immunoprecipitation (RIP) 是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,是了解转录后调控网络动态过程的有力工具,能帮助我们发现miRNA的调节靶点。这种技术运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来,然后经过分离纯化就可以对结合在复合物上的RNA进行测序分析。

安必奇为您提供一站式的RIP-Seq技术服务,从材料选取,建库测序到数据分析,每一步都经过科学缜密的设计,为您深度解析目标RNA种类以及其与蛋白的相互作用,保障高质量的研究成果。

我们的优势
• 性价比高:实验周期短、分析信息全,价格低
• 高覆盖度:全转录组的覆盖,可在全转录组范围内对蛋白结合位点进行筛选和鉴定
• 高灵敏度:每个样本可获得数百万条的序列标签,可发现研究转录组上稀有的蛋白结合位点
• 高精确率:可获得高水平的信噪比数据,准确区分真实事件与噪音,精确定位蛋白结合位点 br />
• 定制化的RNA免疫共沉淀测序方案:可根据实际需求制定个性化的RNA免疫共沉淀测序方案
技术流程

采用特异性抗体对目的蛋白进行免疫沉淀后,分离与其结合的RNA片段,再通过高通量测序与数据分析,在全转录组范围内筛选及鉴定目的蛋白的RNA结合位点,并且可以基于多个样品进行差异比较。

技术流程
数据分析
人全基因组重测序数据分析
样本要求
样本类型 总量 浓度 OD260/OD280
DNA ≥50ng ≥30ng/μl 1.8-2.0

技术参数
测序平台 测序策略 数据量 运转周期
HiSeq SE 50 20M clean reads 视具体项目情况而定

询价及订购

感谢您选择我公司的RIP-Seq测序服务。如有任何相关的问题,请您联系我们的工作人员,我们即刻为您解答和服务。

参考文献
[1] Bersani C, Huss M, Giacomello S, et al. Genome-wide identification of Wig-1 mRNA targets by RIP-Seq analysis [J]. Oncotarget, 2016, 7(2): 1895.
[2] Liu N, Dai Q, Zheng G, et al. N6-methyladenosine-dependent RNA structural switches regulate RNA-protein interactions [J]. Nature, 2015, 518(7540): 560-564.
[3] Kanematsu S, Tanimoto K, Suzuki Y, et al. Screening for possible miRNA–mRNA associations in a colon cancer cell line [J]. Gene, 2014, 533(2): 520-531.