全基因组de novo测序

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De novo测序也叫基因组从头测序,主要针对未知物种的基因组序列,构建不同类型的基因组DNA文库,并进行序列测定。然后通过生物信息学的方法对测序所得到的序列进行拼接、组装和注释,从而获得该物种完整的基因组序列图谱。利用全基因组从头测序技术,可以获得动物、植物、细菌、以及真菌的全基因组序列,从而推进该物种的研究。

安必奇为您提供一站式的基因组de novo测序技术服务,包括从实验设计、样本准备、上机测序到生物信息学分析,旨在为您的基因组学提供完美的解决方案。我们的基因组从头测序技术服务包括:

• 动植物基因组de novo测序
• 细菌基因组de novo测序
• 真菌基因组de novo测序
• 宏基因组de novo测序
我们的优势
• 平台优势:获取高质量的基因组图谱
• 高深度测序:准确率高
• 丰富的数据分析内容:标准分析、高级分析、定制化分析
• 丰富的基因组测序及分析经验:已完成多项大型基因组测序项目
• 定制化的基因组测序方案:可根据实际需求制定个性化的基因组测序方案
技术流程
技术流程
数据分析
I. 动植物基因组de novo测序数据分析
人全基因组重测序数据分析
II. 细菌真菌基因组de novo测序数据分析
动植物基因组重测序数据分析
提供结果
• 比对和counts数计算
• 差异基因表达分析
• 差异转录本表达分析
• 发现新型异构体
• 组装De novo转录组
• 分析基因GO功能
• 定制化信息分析
样本要求
样本类型 总量 浓度 OD260/OD280
动物组织 >500mg
动物组织 >500mg
DNA >400μg ≥30ng/μl ≥ 1.8

技术参数
项目类型 测序平台 测序策略 数据量 运转周期
动植物基因组de novo测序 HiSeq PE150 Contig N50 ≥ 20 kb
Scaffold N50 ≥ 300 kb
视具体项目情况而定
细菌基因组de novo测序 HiSeq PE150 ≤30 scaffolds 视具体项目情况而定
真菌基因组de novo测序 HiSeq PE150 Scaffold N50≥300kb 视具体项目情况而定

询价及订购

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参考文献
[1] Li, Ruiqiang, et al. "De novo assembly of human genomes with massively parallel short read sequencing." Genome research 20.2 (2010): 265-272.
[2] Huang J, Zhao Y, Shiraigol W, et al. Analysis of horse genomes provides insight into the diversification and adaptive evolution of karyotype [J]. Scientific reports, 2014, 4.