全基因组重测序

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全基因组重测序是对已有参考序列的物种进行不同个体的基因组测序,并在此基础上对个体或群体进行差异性分析。通过全基因组重测序以及序列比对,人们可以挖掘到大量的单核苷酸多态性位点(SNP),插入缺失位点(InDel),结构变异位点(SV)和拷贝数变异位点(CNV),实现遗传进化分析及重要性状候选基因的预测 。随着测序成本降低和拥有参考基因组序列物种的增多,全基因组重测序成为动植物育种、群体进化以及人类疾病研究迅速有效的方法

安必奇为您提供一站式的全基因组重测序技术服务,包括从实验设计、样本准备、上机测序到生物信息学分析,为您推出完整的全基因组重测序解决方案,协助您一起探索生物奥秘。我们的全基因组重测序技术服务包括:

• 人基因组重测序
• 动植物基因组重测序
• 微生物基因组重测序
我们的优势
• 平台优势:获取高质量的基因组图谱
• 高通量、高质量测序:效率高,成本低
• 高深度测序:准确率高,Q30平均达85%以上
• 丰富的数据分析内容:标准分析、高级分析、定制化分析
• 丰富的基因组测序及分析经验:已完成多项大型基因组测序项目
• 定制化的基因组测序方案:可根据实际需求制定个性化的基因组测序方案
技术流程
技术流程
数据分析
I. 人全基因组重测序数据分析
人全基因组重测序数据分析
II. 动植物基因组重测序数据分析
动植物基因组重测序数据分析
III. 微生物基因组重测序数据分析
微生物基因组重测序数据分析
样本要求
样本类型 总量 浓度 OD260/OD280
动物样品 >500mg
植物样品 >500mg
基因组DNA ≥3μg ≥20ng/μl ≥ 1.8

技术参数
测序平台 测序策略 指标 运转周期
HiSeq PE150 90Gb 视具体项目情况而定
HiSeq×ten

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参考文献
[1] Patch A M, Christie E L, Etemadmoghadam D, et al. Whole–genome characterization of chemoresistant ovarian cancer [J]. Nature, 2015, 521(7553): 489-494.
[2] Ai H, Fang X, Yang B, et al. Adaptation and possible ancient interspecies introgression in pigs identified by whole-genome sequencing [J]. Nature genetics, 2015, 47(3): 217-225.
[3] Jeffares D C, Rallis C, Rieux A, et al. The genomic and phenotypic diversity of Schizosaccharomyces pombe [J]. Nature genetics, 2015, 47(3): 235-241.