转录组测序

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转录组是指细胞或者组织在某一特定状态下所能转录出来的所有RNA的总和,主要包括mRNA和非编码RNA。高通量测序技术的快速发展使转录组学的研究模式发生了巨大的改变,所衍生出的转录组测序迅速成为研究非模式生物的先进技术。通过高通量测序技术,我们能够在整体水平上探究细胞内基因表达的种类和数量,揭示在特定条件下机体生理生化发生过程以及其中的分子机制。目前该项技术已广泛应用于生物学研究、临床医学研究和药物研发等多个领域。

安必奇为您提供一站式的转录组测序技术服务,包括从实验设计、样本准备、上机测序到生物信息学分析,旨在为您的转录组学提供完美的解决方案。我们的转录组测序技术服务包括

• 真核无参转录组测序
• 链特异性转录组测序
• 原核转录组测序
• 宏转录组测序
• 医学转录组测序
• 单细胞转录组测序
• 比较转录组与泛转录组测序
我们的优势
• 性价比高
• Illumina原装试剂盒,丰富的建库、上机测序经验
• 丰富的数据分析内容:标准分析、高级分析、定制化分析
• 最全面的转录组分析:和传统方法相比,高通量转录组测序不需要预先设计特异性探针,可以对任何一个物种的转录组进行分析
• 覆盖度高:能够测定几乎所有转录本片段的序列
• 检测范围:能够精确检测从几个到数十万个拷贝
技术流程
技术流程
数据分析
I. 无参转录组测序
无参转录组测序
II. 有参转录组测序
有参转录组测序
提供结果
• 比对和counts数计算
• 差异基因表达分析
• 差异转录本表达分析
• 发现新型异构体
• 组装De novo转录组
• 分析基因GO功能
• 定制化信息分析
样本要求
样本类型 总量 浓度 OD260/OD280
动物组织 >2g
植物组织 >4g
总RNA >4μg ≥50ng/μl ≥ 1.8
cDNA ≥2μg ≥10ng/μl ≥ 1.8

技术参数
测序平台 测序策略 指标 运转周期
HiSeq PE125 >4G clean dat 30个工作日

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参考文献
[1] Pan L, Zeng W, Niu L, et al. PpYUC11, a strong candidate gene for the stony hard phenotype in peach (Prunus persica L. Batsch), participates in IAA biosynthesis during fruit ripening [J]. Journal of experimental botany, 2015: erv400.
[2] Yu Y, Fuscoe J C, Zhao C, et al. A rat RNA-Seq transcriptomic BodyMap across 11 organs and 4 developmental stages [J]. Nature communications, 2014, 5.
[3] Kang C, Darwish O, Geretz A, et al. Genome-scale transcriptomic insights into early-stage fruit development in woodland strawberry Fragaria vesca [J]. The Plant Cell, 2013, 25(6): 1960-1978.